[After Effects] Sugerencias con mascaras en After Effects

After effects ayuda con máscaras en After Effects. Hola, tengo una duda que hace mucho no he podido responder, pero ojalá me puedan ayudar. Mirén:
Tengo un video mostrando el cielo, en este, hay unas ramas de los árboles que tapan una parte del cielo, bueno, ahora, tengo una imagen, donde sale una nave (space ship) (la imagen están en RTF, la saque de 3ds Max max), entonces, la poner la imagen (la nave) sale sobre las ramas, aquí está mi duda:
Como hago para que la nave, este tras las ramas? Por que intente con una máscaras de cuadrados, círculos, pero no son perfectas, entonces quedan espacios que se notan que hay algo sobre puesto.

Ayuda urgente.