Animar ojos 2d

Hola, tengo un problema, a ver si se os ocurre cómo solucionarlo. Me gustaría animar unos ojos 2d en un personaje 3d, había pensado en animar el parpadeo, el movimiento de las pupilas, y ponerlo en un avi o algo así, pero no se me ocurre cómo hacer para que se reproduzca entre los frames que yo quiero.

Quizás no lo estoy enfocando por dónde tendría que hacerlo, pero no sé por dónde continuar.

A ver si hay suerte y me echáis un cable porque yo ya me he estrujado el cerebro y no soy capaz. Gracias.

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