A ver, gracias por las respuestas.
1, estuve probando y descubrí bien cuál era el problema, cuento lo que he hecho y como lo solucione.
El problema.
-Creo una composición nueva, y luego le doy import footage aquí importo un video en formato (*.mov) (en todo caso sucede lo mismo con los, mpg y.avi) voy a operadores y doy dibujar máscara, y dibujo una de 3 puntos, luego doy animate y ánimo solo 2 puntos, desactivo animate y retrocedo el video hasta dónde cree la máscara, luego doy animate de nuevo y cuando intento animar nuevamente los dos puntos que había animado anteriormente estos no se mueven o se mueven para cualquier lado o cómo si estuvieran trabados, pero, sin embargo, el punto que no había animado lo puedo mover perfectamente.
Esto de los puntos raros solo sucede cuando intento animar nuevamente los puntos en un tramo de la película en que la máscara ya ha sido animada, pero si adelanto la película y ánimo esos puntos problemáticos, ya no hay problema.
En resumen ese era el problema, he hecho algo mal?
La solución (al menos eso creo).
-Luego se me ocurrió tomar el video y sin tocar nada, dar render y darle una salida en formato. Tga.luego importe la secuencia e intente hacer lo mismo que describí anteriormente, y sorpresa, ahora no hay ningún problema, puedo mover os puntos normalmente, porque, ni idea.
Aquí me salen dos preguntas:
-Como se suele hacer, trabajar directamente con el video en formato (*.mov), mpg, avi, o trapasar todo a formato. Tga?
-La otra, hay perdida de información o calidad en este traspaso de formato de video a formato de secuencia de imágenes?
Me he entusiasmado un poco a ver si ponen paciencia y me echan una mano. Saludos.
Posdata: gracias Stewie por la respuesta del pto 2 era lo que buscaba, aunque en vez de la tecla alt, creo que es Control, (con Alt me hace una cosa rara que ni idea que es, como que crea puntos fuera de la máscara, no se).