Cura genera capas donde no debería

Aquí voy con mi primera consulta!
Estoy diseñando una caja para un proyecto de elctrónica y resulta que en las columnas donde pasan los tornillos para cerrar la tapa, se crean unas capas que tapan el agujero (de hecho, también le añade relleno)
El diseño está hecho con SketchUp, ya que no dispongo de tanto conocimiento de blender como para hacerlo (y en SketchUp, visto así, es más sencillo); en esta primera imagen se puede ver como debería quedar el elemento en sí.
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En esta imagen se puede ver como en la capa 13 está generando el relleno (que no debería tener)
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Y por último, esto corresponde a la capa 3, y se puede ver que no genera el agujero para poder pasar el tornillo
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Por último, en esta pregunta de otro compañero Por que diseño una pieza y en Cura no me sale parte de la pieza al darle a ver capas he podido ver que si no están bien limitados los planos del modelo, puede dar problemas. Si no me equivoco con el concepto, interpreto que el interior está bien
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Un saludo y espero haber adjuntado información suficiente como para que me podáis brindar una ayuda; en caso contrario, decidmelo y subo lo que haga falta.
Miniaturas adjuntas
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