Hola Cristina. La diferencia es que con el file enlace manager enlazas el archivo de AutoCAD al max/Viz y cada vez que en el AutoCAD añades o modificas algo en el max/Viz le das al reload del file enlace manager y te actualiza todas la geometría o la que tú selecciones.
Ventajas, no tienes que volver a poner materiales, uwmaps, atachar objetos.
Ojo:
En el VIZ 2007 no funciona el file enlace manager a nadie.
En e max8 no sé si funciona.
Los que tengan el viz2006 que no se actualicen al VIZ 2007. Saludos.