Intentaré explicarme mejor con unas capturas de un cubo, en la primera captura tengo un cubo con polígonos marcados que quiero extruír hacia adentro para hacer una ranura. En la segunda captura se observa mi problema, al hacerlo quedan como unas tapas en los extremos de la ranura, que cuando quiero eliminarlas compruebo que no es tan sencillo, ya que el polígono (esta marcado en la tercera captura) es más grande que la zona qué esta tapando.
Por supuesto que ya lo he solucionado conjunto de acciones que requieren desoldar y soldar vértices, pero mi pregunta se apunta más a saber si hay una forma más sencilla de hacer lo mismo. Aclaro que no puedo seleccionar los demás polígonos y extruírlos hacia arriba porque esto es solo un ejemplo, con un objeto más complejo no estaría dentro de las opciones.