Hola. Prueba lo siguiente: Pulsa la letra n, para que aparezca la ventana flotante con las coordenadas de transformación.
Selecciona los vértices o aristas que quieras extruir.
Pulsa e para extruir, pero no extruyas nada, es decir, coloca los objetos extruidos encima de los originales (si hace falta mantén pulsada la tecla control para activar el ajuste).
Termina la operación de extrusión.
Y ahora, en la ventana de transformación de coordenadas, incrementa el eje que necesites (probablemente z) y voila. – ya lo tienes. Un saludo.