Keith Lango lo hace en Maya, y dice que el efecto de línea lo hace con el ton de Maya y el pase de color con el Mental Ray. Luego lo compone con After Effects:
The color pass is rendered in Mental Ray todo get the Shading i want, and the ton line pass is rendered using Maya renderer.
Lo chulo es aplicarle un ruido animado a la malla del personaje con un desfase entre el pase de color y el de línea, además de animar una textura en el canal del grosor de la línea en el ton para que el grosor varíe con cada frame.