Bueno, publique antes una respuesta, pero no salio. Era más o menos:
-Cuando exporto lo suelo hacer todo a la vez, pero, aunque lo haga poco a poco, me sigue pasando eso.
Antes probé a importar directamente de Cad a max (el AutoCAD 2004 y el max 5 no funcionan al importar, pero lo pasé a Cad 2000) y me quedo peor.
Trabajo con polilíneas, y creo que no tengo líneas dobles ni cosas por el estilo, solo que algunas fachadas no encajan (los planos en 2d estaban mal).
Ahora mismo cuando coloco un material, en los elementos que me dan problemas, pues marco, dos lados y facetado y así se elimina. Al menos para este apuro. Gracias por las respuestas, seguiré probándolas.