Morph targets

Si no recuerdo mal, debería ser así. En la pila de modificadores, arriba del morphing, le aplicas a la cabeza el modificador edit Mesh, luego, a nivel subobjeto haces un attach al cuerpo. Hay que soldar los vértices que coincidan entre ambas mallas, luego aplicas el modificador skin o Physique, según el caso y posteriormente el Mesh Smooth seguidamente le aplicas el skin y luego por último el Mesh smooth, de esta forma siempre tendrás control sobre la malla y no te afectara lo que hayas hecho con el morphing, la pila de modificadores debería quedar así.

Mesh smooth, skin (o Physique).

Edito Mesh, morphing, edit Mesh, el Mesh Smooth siempre va arriba, para que puedas animar con pocos polígonos, que es lo óptimo. Lo activas solo para el render. (o hacer pruebas, claro). Un saludo de Shazam.