No Irene, en AutoCAD no se pueden animar las capas, al menos hasta la versión 2008, aún no me he puesto con la versión 2010 (la 2009 me la voy a saltar) pero dudo mucho que se pueda hacer eso.
En AutoCAD, hasta lo que yo sé, solo se puede animar una cámara, o sea, hacer un paseo virtual de una cámara sobre un modelo y estoy casi seguro de que tampoco se pueden hacer animaciones de objetos.
Así que veo difícil que puedas conseguir lo que quieres.