Problema al pasar de 3ds a obj

Hola amigos tengo un problema al pasar de formato (*.3ds) a (*.obj), ya que, al pasarlo me crea unos triángulos en determinadas zonas como las ventanas y pared, que yo supongo que, es cuando triangula el programa el modelo para pasarlos.

He intentado editarlo en 3d Studio para poder borrarlos o desplazarlos, pero me deforma el modelo, o me elimina las paredes, y no sé qué hacer.

Todo esto lo estoy haciendo para trabajar desde Maxwell Studio, para hacer el render del interior, y no los puedo dejar porque me tapan las ventanas.

Alguna idea o sugerencia de cómo solucionar esto? Un saludo.

Cuando lo termine lo colgaré en trabajos terminados para que me digáis que tal.