Problema con explode y pintura de peso

A ver.

Que yo sepa, lo que pretendes hacer, no se puede hacer de ese modo.

Lo primero que te puedo decir es que estas usando un grupo de vértices en el campo para protegerlo (es decir para qué no exploten) y lo que quieres es que exploten a distinto tiempo, cosa que no veo lógica.

Lo segundo es que para hacer desaparecer un objeto progresivamente a lo largo de su recorrido tienes el modificador Build que hace exactamente eso, desaparecer una malla polígono a polígono en un orden.
¿Qué cómo se ajusta ese orden?
Pues seleccionando el objeto y pulsando Ctrl+F para elegir una opción.

Además, de esto, también hay otros modos de hacerlo, como, por ejemplo, animar una textura del canal alpha.