Shape merge me rompe las mallas

Buenas, resulta que el uso del shape merge me rompe las mallas por así decirlo, como veis en las imágenes, ai alguna forma de crear en los objetos formas para poder así extruirlas y demás?
Miniaturas adjuntas
Shape merge me rompe las mallas-spline.jpg   Shape merge me rompe las mallas-spline2.jpg  

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