Hola Xtreme, respecto a usar Photoshop para hacer anaglifos, hay varios modos de afrontar el asunto, el enlace proporcionas es un método fiable.
Pero es mucho más cómodo usar stereophotomaker, ya que es un programa optimizado para ello, tendrás anaglifos en dos clicks de ratón, y un montón de opciones para alinear, fijar la ventana, amén de un montón de opciones de salida, anaglifos, pares, entrelazados, lo que necesites.
Respecto a las gafas, la verdad es que conviene guardar las que uno va encontrando en revistas y tal porque no son fáciles de encontrar sueltas, de todos modos pregúntale a san google y seguro que encuentras mil sitios que las venden, otra opción es hacértelas tu mismo.
Una cosa que te recomiendo, es aprender a ver pares estéreo sin lentes ni aparatos, se llama visión libre, y solo requiere un leve aprendizaje, si tienes uno de esos libros del ojo mágico, se trata del mismo método.