Hay una muy fácil: crea un plano del tamaño de la cámara, asígnale como textura el vídeo, y gíralo 90 grados. Renderiza. Ya está.
O descompón el vídeo en secuencias de (*.tga) o lo que sea, rota las imágenes con un script o macro o lo que quieras, y vuelve a codificarlas a vídeo.
El sonido lo sacas del original y lo montas con algún programa de edición de vídeo con el modificado. O se lo pones como sonido si eliges la opción de renderizar.
O tal vez alguno de los programas de edición de vídeo profesionales (Adobe Premiere) tengan esa opción. No me suena en el Virtualdub haber visto algo así.